على الرغم من المميزات المتعددة التي يوفرها استخدام الهارمونيك في التداول إلا أن هناك بعض العيوب الشائعة أيضا، ومنها:
نموذج هارمونيك
إن نماذج الهارمونيك في التحليل الفني لها العديد من الأنماط، فالأضلاع المكونة للنموذج التوافقي دائما ما ترتبط بنسب فيبوناتشي وهو المحور الرئيسي لتحركات الأسعار، ولذلك تعتمد الأنماط التوافقية بشكل رئيسي على نسب فيبوناتشي، فإن كان هناك نمط واحد فقط فيمكن للتاجر أن يتذكر تلك النسب، ولكن على العكس فهناك أكثر من ست نماذج توافقية مما يصعب على التاجر دراسة وتذكر كل الأنماط بدون استخدام المؤشرات أو البرمجيات المختصة بذلك، إلى جانب صعوبة تحديد النموذج التوافقي الذي يمكن أن يحقق النجاح ويوفر مكاسب كبيرة.
واحدة من أكثر المشكلات شيوعا والتي تواجه معظم المبتدئين، هي إمكانية ظهور إشارات متضاربة من النماذج التوفيقية، وخاصة تلك التي تتطور في أكثر من إطار زمني مختلف، لدرجة أنه يمكن ملاحظة اثنين من النماذج الهابطة والصاعدة في آنٍ واحد، وهو ما قد يخلق بعض التشتت في أذهان التجار.
الاحتمالات الكبيرة بملامسة وقف الخسارة، فالتجار ممن يتبعون قواعد التداول التوافقي بشكل دقيق عادة ما يجزمون بدقة المستويات سواء للدخول أو لوقف الخسارة، وبالرغم من ذلك فإن تلك المستويات قد تكون عرضة للتلاعب من التجار الرئيسيين، وقد يكون ذلك من أهم العيوب الرئيسية لنماذج الهارمونيك.